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有關(guān)修飾肽的溶解性的一些問(wèn)題及解答
作者:固拓多肽合成公司    發(fā)布于:2022年09月06日
摘要:1、非HPLC純化的里面有什么雜質(zhì)?答:粗品和脫鹽等級(jí)的修飾肽中修飾肽與非修飾肽類雜質(zhì):如非全長(zhǎng)修飾肽和修飾肽后處理的某些原材料如DTT、TFA等。2、HPLC純化的有什么雜質(zhì)?答:通過(guò)HPLC純化的修飾肽,仍會(huì)有很多的雜質(zhì)出

1、非HPLC純化的里面有什么雜質(zhì)?

答:粗品和脫鹽等級(jí)的修飾肽中修飾與非修飾肽類雜質(zhì):如非全長(zhǎng)修飾肽和修飾肽后處理的某些原材料如DTT、TFA等。

2、HPLC純化的有什么雜質(zhì)?

答:通過(guò)HPLC純化的修飾肽,仍會(huì)有很多的雜質(zhì)出現(xiàn),這里面的雜質(zhì)通常是短肽和少許TFA。

3、多長(zhǎng)的為適合?

答:修飾肽合成必須考慮修飾肽的長(zhǎng)度,電荷,親疏水性等多種因素??傞L(zhǎng)度愈長(zhǎng),合成粗品的純度和產(chǎn)出率也隨之下降,純化難度系數(shù)和難以合成的概率便會(huì)更大。不過(guò)修飾肽功能區(qū)的序列是沒(méi)有辦法更改的,但為了修飾肽的圓滿合成,有時(shí)候只能在功能區(qū)的上下游添加一些輔助氨基酸,以提升修飾肽的溶解度和親疏水性。倘若修飾肽過(guò)短,合成可能會(huì)出現(xiàn)問(wèn)題,首要難題是合成的修飾肽在后處理過(guò)程中具有一定的困難,5肽以內(nèi)的修飾肽,通常得有疏水的氨基酸,不然后處理難度較大。15個(gè)氨基酸殘基以下的修飾肽一般來(lái)說(shuō)可以得到令人滿意的產(chǎn)出率和得率。

有關(guān)修飾肽的溶解性的一些問(wèn)題及解答

4、怎樣從序列中判斷修飾肽的溶解性?

(1)修飾肽中要是富含高比例的疏水性比較強(qiáng)的氨基酸如Leu,Val,IIe,Met,PheTrp,修飾肽不容易溶解于水性溶液中或幾乎無(wú)法溶解。這種氨基酸不論是純化或合成,都可能會(huì)出現(xiàn)問(wèn)題。

(2)正常情況下疏水性氨基酸的占比<50%,無(wú)法持續(xù)5個(gè)接連aa為疏水性,帶電荷的氨基酸的占比可達(dá)20%,在修飾肽的NC短如果可以增多極性氨基酸,也能夠改善溶解性。

5、為何帶有Cys,Met,Trp的難合成?

答:含有Cys,Met,或Trp的修飾肽無(wú)法合成,并且難以獲得純度高的產(chǎn)品。主要是由于這些基團(tuán)不太穩(wěn)定,易氧化。使用和貯存這些修飾肽都要特別注意,防止重復(fù)打開(kāi)蓋子。

6、為什么有的的合成產(chǎn)率或純度會(huì)非常低?

答:修飾肽合成與引子合成有相當(dāng)大的差異,無(wú)法合成的引子非常少,但是經(jīng)常會(huì)有無(wú)法合成的修飾肽。如Val,Ile,Tyr,Phe,Trp,Leu,Gln,Thr這樣的氨基酸比鄰或循環(huán)時(shí),修飾肽鏈在合成流程中無(wú)法完全舒展溶解,合成效率降低。以下這些情況,合成效率和產(chǎn)物的純度都非常低,如:重復(fù)Pro,Ser-Ser,重復(fù)Asp,4個(gè)連續(xù)Gly等。

7、是怎樣純化的?

答:修飾肽純化一般采用反相柱(C8,C18),214nm。緩沖體系一般是含TFA的溶液,pH2.0。BufferA為含0.1%TFAinddH2OBufferB1%TFA/ACN/pH2.0。純化之前要用BufferA溶解;倘若溶解欠佳,用BufferB溶解后,隨后用BufferA稀釋;對(duì)疏水性高的修飾肽,有時(shí)候還要添加少許的FormicAcid或醋酸。

 

寫(xiě)到最后:

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