質(zhì)譜分析（MS）它是一種強(qiáng)大的分析肽的技術(shù)。根據(jù)其質(zhì)荷比分離運(yùn)動離子，用電場和磁場進(jìn)行檢測。離子的化合物組成可以通過測量離子的精確質(zhì)量來確定。

質(zhì)譜分析對樣品有一定的要求。進(jìn)行GC-MS分析的樣品應(yīng)該是有機(jī)溶液，水溶液中的有機(jī)物一般無法測量，需要提取分離成有機(jī)溶液，或者采用頂空進(jìn)樣技術(shù)。有些化合物極性太強(qiáng)，在加熱過程中容易分解，比如有機(jī)酸化合物。此時可以酯化，將酸轉(zhuǎn)化為酯，然后進(jìn)行GC-MS分析。酸的結(jié)構(gòu)可以從分析結(jié)果中推斷出來。如果樣品不能汽化或酯化，則只能進(jìn)行LC-MS分析。LC-MS分析的樣品最好使用水溶液或甲醇溶液，LC流動相中不應(yīng)含不揮發(fā)鹽。對于極性樣品,可采用ESI源，對于非極性樣品,采用APCI源。

雖然MS法本質(zhì)上是一種純物理方法，但它廣泛應(yīng)用于藥物分析領(lǐng)域，尤其是與其他分析儀器和計算機(jī)聯(lián)合使用，具有高靈敏度、特異性和高速等特點(diǎn)，可以解決大量的藥物分析問題。

在MS中，電荷被添加到藥物中的各種分子中，然后這些分子受到電場的影響。這些分子的后續(xù)運(yùn)動取決于其電荷與質(zhì)量的比率，因此有可能在樣品的數(shù)百種成分中識別單個分子類型。在MS之前，液相色譜（LC）分離混合物的成分可以更好地檢測單個分子成分。由于其高靈敏度、精度和分離具有相似序列肽的能力，這種分析方法的組合可能對肽藥產(chǎn)品中的各種成分進(jìn)行無價檢測和分析，這種成分可能是單肽藥物中與肽相關(guān)的雜質(zhì)或肽混合物的特定序列。

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