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這類抗菌肽最開始是由蟲類哺乳類、兩棲類等等的防御體系中分化獲得的,其主要包含4類:
1.殺菌肽(cecropin)最開始是由西哥羅佩蛾(Cecropiamoth)的免疫淋巴中存在,它們主要存在于其它蟲類中,并且在豬腸中也發(fā)現(xiàn)相似的殺菌肽。它們有一個典例特點是在一個長的疏水片段后邊接有有一個強堿性的N-端區(qū)域。
2.爪蟾抗菌肽爪蟾抗菌肽(magainin)來源于蛙的肌肉和胃內。結構研究發(fā)現(xiàn),爪蟾抗菌肽也呈螺旋構型,尤其是在疏水環(huán)境下。使用N-標識的固相NMR研究爪蟾抗茵肽在脂兩層里的構型,基于酰氨共振的化學位移,顯示出爪蟾抗菌肽的螺旋是平行雙分子層表面,它們匯聚能夠形成一個13mm的籠,且具有有一個30mm的周期性螺旋結構。
3.防衛(wèi)肽防衛(wèi)肽(defensin)來源于人多核具有完全核分葉的嗜中性白細胞兔多聚巨噬細胞及其動物的腸細胞中。從蟲類之中提取到了一組類似于哺乳類防衛(wèi)肽的抗菌肽,稱做“蟲類防衛(wèi)肽”。與哺乳類的防衛(wèi)肽不一樣,“蟲類防衛(wèi)肽”只對革蘭氏陽性菌有活性。即使蟲類防衛(wèi)肽也含有6個Cys殘基,但彼此之間的二硫鍵連接方法則不同。從果蠅中提取的抗菌肽分子內二硫橋結合方式與植物防衛(wèi)肽一樣。在晶體條件下,防衛(wèi)肽以兩聚體形式呈現(xiàn)。
4.Tachyplesin是由馬蹄蟹(horseshoecrab)中分化到的。構型研究表明它采用反平行的B-折疊式構型(3~8位、11-16位),其中以β-轉角相互連接(8~11位),還會在7和12位、3和16位間產生兩個二硫鍵。在這個結構上,疏水的氨基酸被定位在平面的一側,六個陽離子殘基則出現(xiàn)在分子尾端,所以,它的結構也是雙嗜性的。
由此可以得出,即使這類抗菌肽在長短上天差地別但幾乎所有抗菌肽在本質上就是陽離子型的;在高端結構上,不管是以α-螺旋或是β-折疊式形式呈現(xiàn),雙嗜性結構是它們共同特征。
寫到最后:
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