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經(jīng)常使用的多肽的書寫有兩種類型——單字母和三字母方式。不管是哪一種方式書寫。只要同屬于一條肽鏈,則它要表達(dá)的多肽結(jié)構(gòu)便是相同的。書寫出的多肽序列不只是自己可以懂得,讓他人也可以正確認(rèn)識。為防止出現(xiàn)解析爭論;國際上一致規(guī)定:多肽的N端(氨基端)在最左邊,多肽的C端(羧基端)在最右邊。
多肽的單字母書寫形式
簡單來說就是一個(gè)字母表示一個(gè)氨基酸(便于記錄和書寫)。氨基酸的單字母選取并不是隨便的。目前通用的單字母規(guī)則主要是比較常見的20種氨基酸,氨基酸用大寫字母(L-氨基酸)表示。例如A表示L-丙氨酸(Alanine)、C表示L-半胱氨酸(Cysteine)和G表示L-甘氨酸(Glycine)。倘若氨基酸的結(jié)構(gòu)變化,例如D-丙氨酸(Alanine),在用單字母表示時(shí),我們則用小寫字母表示。例如D-丙氨酸(Alanine)用a表示,D-異亮氨酸(Isoleucine)用i表示和D-甲硫氨酸(Methionine)用m表示。
多肽序列單字母書寫舉例
①多肽序列1:GTFLVRCDMA,共10個(gè)氨基酸,所有字母均是大寫,則表示所有的氨基酸均是天然存在的L型氨基酸。
②多肽序列2:GTFLvRCdMA,共10個(gè)氨基酸,序列里面有兩個(gè)氨基酸是小寫,說明對應(yīng)的兩個(gè)氨基酸是D型氨基酸。
③多肽序列1:GTFLVRCDMA也可以寫成H-GTFLVRCDMA-OH,左邊的H-代表N端的氨基,右邊的-OH代表C端的羧基。不過一般通常為了美觀整齊,H-和-OH同時(shí)寫或同時(shí)不寫。
④多肽序列3:GTFLVRCDMA-NH2,與多肽序列1的區(qū)別是,右邊多了-NH2,代表C端酰胺化。
⑤多肽序列4:AC-GTFLVRCDMA,與多肽序列1的區(qū)別是,左邊多-AC,代表N端乙酰化。
多肽的三字母書寫方式
什么叫三字母?
簡單來說就是三個(gè)字母代表一個(gè)氨基酸,并且三字母和前面提到的單字母是一一對應(yīng)關(guān)系。三個(gè)字母中,第一個(gè)字母大寫,第二和第三個(gè)字母小寫,如丙氨酸(Alanine)用Ala表示、半胱氨酸(Cysteine)用Cys表示。
多肽三字母書寫舉例
①多肽序列1對應(yīng)的三字母書寫為:H-Gly-Thr-Phe-Leu-Val-Cys-Asp-Met-Ala-OH.
②多肽序列3對應(yīng)的三字母書寫為:H-Gly-Thr-Phe-Leu-Val-Cys-Asp-Met-Ala-NH2,C端酰胺化。
③多肽序列4對應(yīng)的三字母書寫:Ac-Gly-Thr-Phe-Leu-Val-Cys-Asp-Met-Ala-OH左邊多-Ac,代表N端乙酰化。
特殊多肽序列的書寫
例如:磷酸化氨基酸的書寫
①:H-Gly-pThr-Phe-Leu-Val-Cys-Asp-Met-Ala-OH
②:H-Gly-Thr(PO3H2)-Phe-Leu-Val-Cys-Asp-Met-Ala-OH
寫到最后:
杭州固拓生物科技有限公司定制多肽合成業(yè)務(wù):藥物肽、臨床肽、訂書肽、淀粉肽、醛肽、環(huán)肽、二硫鍵搭橋多肽、穿膜肽、各種抗菌肽、美容肽、磷酸化肽、PEG肽、偶聯(lián)BSA和KLH抗原肽、各類酸修飾多肽、各種胺類化合物修飾多肽(苯胺、異戊胺、二乙胺)、各類榮光標(biāo)記(FITC、FAM系列、DOTA、TAMRA系列、Cy系列)同位素肽等。
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