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潛在的多肽降解方法
作者:固拓多肽合成公司    發(fā)布于:2024年01月25日
摘要:肽的耐化學(xué)性取決于氨基酸的成分和序列。凍干肽通常比溶液中的對應(yīng)物更持久。肽的潛在降解方法如下:1、水解:這通常包含在序列中的Asp中(D)對于肽中的問題,它非常容易脫水形成環(huán)形酰亞胺中間體。例如,序列中有Asp。-P

的耐化學(xué)性取決于氨基酸的成分和序列。凍干肽通常比溶液中的對應(yīng)物更持久。肽的潛在降解方法如下:

1、水解:這通常包含在序列中的Asp中(D)對于肽中的問題,它非常容易脫水形成環(huán)形酰亞胺中間體。例如,序列中有Asp。-Pro(DP)在這種情況下,酸催化產(chǎn)生的環(huán)形酰亞胺中間體會導(dǎo)致肽鏈的切割。類似地,序列中存在Asp-Gly(DG)在這種情況下,環(huán)形中間體可以水解成異天冬氨酸的原始Asp模式(無害)或潛在的非活性類似物。最后,所有天冬氨酸模式都可以完全轉(zhuǎn)化為異天冬氨酸類似物。在較小的水平上,它含有Ser(S)這個序列還可以形成一個環(huán)形酰亞胺中間體,可以最終切割肽鏈。

2、脫酰胺:這種堿催化反應(yīng)經(jīng)常發(fā)生在含有Asn的情況下-Gly(NG)或Gln-Gly(QG)在序列中,并遵循類似的Asp-Gly(DG)序列機(jī)制。Asn-Gly序列中的脫氨基(胺丟失)產(chǎn)生環(huán)形酰亞胺中間體,然后水解產(chǎn)生Asn天冬氨酸或異天冬氨酸類似物。此外,環(huán)形酰亞胺中間體可以導(dǎo)致D-Asp或外部消旋轉(zhuǎn)化為AsnD-iso-類似于Asp的東西,所有這些都可能是非活性的。

3、氧化:Cys和Met殘留物是經(jīng)歷可逆氧化的主要?dú)埩粑?。半胱氨酸的氧化在更高的pH值下加速,其中硫醇更容易去除質(zhì)子化,并且容易在鏈中或鏈間產(chǎn)生二硫鍵。使用二硫蘇糖醇(DTT)或三(2-羧乙基膦)鹽酸鹽鹽(TCEP)處理可以很容易地逆轉(zhuǎn)二硫鍵。甲硫氨酸通過化學(xué)和光化學(xué)進(jìn)行氧化,產(chǎn)生甲硫氨酸二氧化物,進(jìn)一步進(jìn)入甲硫氨酸二氧化物,兩者都很難逆轉(zhuǎn)。

潛在的多肽降解方法

4、二酮哌嗪和焦谷氨酸的產(chǎn)生:當(dāng)二甲基哌嗪的形成通常發(fā)生在Gly位于N端的第三位時,尤其是如果Pro或Gly位于1或2位。這種反應(yīng)涉及到N端氮的親核攻擊在第二氨基酸和第三氨基酸之間的酰胺芐基上,導(dǎo)致二酮哌嗪方法的前兩個氨基酸被切割。另一方面,如果Gln位于N端,焦谷氨酸的形成幾乎是不可避免的。這是一種類似的反應(yīng),其中N端氮攻擊Gln的側(cè)鏈基碳,形成焦谷氨酸肽類似物脫氨基。這種轉(zhuǎn)換也發(fā)生在N端含有焦谷氨酸肽類似物。

5、外消旋化:這個術(shù)語廣泛應(yīng)用于指氨基酸或肽的手性完整性的整體損失。外消旋化涉及將堿催化對映異構(gòu)體(通常為L型)的氨基酸轉(zhuǎn)化為L型和D型對映異構(gòu)體的1型。:1.混合物。在肽生成過程中,這一點(diǎn)比較重要,但成品肽中的問題較少。另外,這種轉(zhuǎn)換很難被發(fā)現(xiàn),也無法控制。

避免或最小化肽降解的一般方法是將肽降解到-20℃或更好-80℃以冷凍干燥的方式儲存(如果有的話)。如果肽在水溶液中,應(yīng)冷凍每個等分樣品,以避免凍融。應(yīng)避免暴露在pH>中 8.但是,如果需要pH>的話 8時融解肽,則應(yīng)將其暴露最小。

寫到最后:

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