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丙氨酸掃描肽庫(kù)(Alanine Scanning Library)
Ala掃描多肽庫(kù)是識(shí)別序列中特定氨基酸對(duì)多肽功能的影響的一種方法。我們依次用Ala代替序列中的氨基酸;通過(guò)Ala掃描多肽庫(kù),可以識(shí)別特定氨基酸對(duì)整個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、功能等生物活性的影響。
單位點(diǎn)擊掃描多肽文庫(kù)(Positional Scanning Library)
單位點(diǎn)掃描多肽庫(kù)是優(yōu)化多肽序列的重要工具。系統(tǒng)地用其他氨基酸代替多肽選定的區(qū)域或位點(diǎn),并通過(guò)多肽活性測(cè)定確定該位點(diǎn)的最佳氨基酸。這種肽庫(kù)有助于研究人員在特定位置發(fā)現(xiàn)具有特殊影響或活性的特定區(qū)域。
首尾搭配多肽文庫(kù)(Overlapping Library)
首尾多肽庫(kù)是篩選線性或連續(xù)表位的常用方法。肽庫(kù)的設(shè)計(jì)主要由肽長(zhǎng)設(shè)計(jì)。(peptide length)和步移(offset number)兩個(gè)參數(shù)決定。蛋白質(zhì)從N端開(kāi)始,逐漸截取到C端后,很可能會(huì)剩下一個(gè)孤肽(Orphan peptide),為了保持一致的長(zhǎng)度,我們建議將N端轉(zhuǎn)移一個(gè)或幾個(gè)氨基酸。
截頭多肽文庫(kù)(Truncation peptide libraries)
截頭多肽庫(kù)被用來(lái)確認(rèn)多肽序列中最短的氨基酸序列。截頭多肽庫(kù)的建立方法通常是系統(tǒng)地去除原多肽序列兩側(cè)的氨基酸。如果已知一些重要的氨基酸,則應(yīng)保留這些氨基酸序列,然后從肽的另一端逐個(gè)去除氨基酸,開(kāi)始篩選。
隨機(jī)多肽文庫(kù)(Random Peptide Library)
隨機(jī)多肽圖書(shū)館通過(guò)鳥(niǎo)槍法設(shè)計(jì)了20種天然氨基酸。(shotgun approach)同時(shí),隨機(jī)替代選定的氨基酸殘基。
雜亂肽庫(kù)(Scrambled Library)
Scrambled Library的設(shè)計(jì)是基于原多肽氨基酸序列的內(nèi)部置換。它是突變程度最高的多肽庫(kù),被破壞的多肽通常被用作陰性對(duì)照,以證明特定的序列是蛋白質(zhì)功能或活性的關(guān)鍵。它也是一種隨機(jī)篩選工具,用于找到新的目標(biāo)。
寫(xiě)到最后:
杭州固拓生物科技有限公司定制多肽合成業(yè)務(wù):藥物肽、臨床肽、訂書(shū)肽、淀粉肽、醛肽、環(huán)肽、二硫鍵搭橋多肽、穿膜肽、各種抗菌肽、美容肽、磷酸化肽、PEG肽、偶聯(lián)BSA和KLH抗原肽、各類(lèi)酸修飾多肽、各種胺類(lèi)化合物修飾多肽(苯胺、異戊胺、二乙胺)、各類(lèi)榮光標(biāo)記(FITC、FAM系列、DOTA、TAMRA系列、CY系列)同位素肽等。固拓生物所有產(chǎn)品僅限科研使用,不得用于人體,如有違反,后果自負(fù)。
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